La bandera de Jayuya tiene una historia similar a la del escudo. Es de forma rectangular. Sobre un fondo rojo, una faja de picos verdes con bordadura blanca divide horizontalmente la bandera. La bandera de Jayuya simboliza espíritu de un pueblo que se enorgullece de ser la cuna de la cultura taína.
El Escudo de Jayuya resume la vida de un pueblo, que ubicado en el corazón de Puerto Rico, proyecta nobleza, la fe y el sentimiento de tierra adentro. Es un blasón de figura geométrica, cuyo tope es una línea recta horizontal y su base de forma cónica circular. Su fondo rojo simboliza la convivencia y la confraternidad que caracteriza a los jayuyanos. Sobre el escudo descansa una corona en forma de castillo o fortaleza, con tres torres equidistantes, que representan el carácter municipal del escudo. Dentro del escudo, centralizado en la parte superior, la corona de diseño taíno, que es símbolo genérico de la monarquía representando al Cacique Hayuya. Al centro se forma una faja de picos verdes con bordadura blanca, que representan los tres Picachos, el verdor de nuestros campos y también a la Virgen de la Monserrate (Monte Serrado), Patrona de Jayuya.
