Escudo cuartelado: (1) y (4), en campo de azur, un templo griego de plata, (2) y (3), en campo de plata un Manatí de sable, curvado, y brochante sobre el todo en abismo, un escusón de gules cargado de cinco Ilamas de oro, puestas en aspa. Al timbre, corona mural de plata de tres torres, nada de sable y adjurada de gules y bajo el escudo un volante blanco con la inscripción ATENAS DE PUERTO RICO en letras de sable. El templo griego representa a la ciudad de Atenas, cuyo edificio característico, el Partenón fue uno de los principales templos dedicados en Grecia a Atenas, diosa de la Sabiduría, a la que, según la leyenda, debió su nombre la ciudad. En el escudo simboliza además el apelativo de "Atenas de Puerto Rico" dado a Manatí, por haber sido en las primeras décadas de este siglo, centro destacado juegos florales, veladas, conferencias, certámenes musicales y otras actividades de índole cultural que atrajeran a la ciudad a las figuras más conspicuas de las letras y de las artes de Puerto Rico. El Manatí alude directamente al nombre indígena de la ciudad. Las Ilamas simbolizan las fogatas con que tradicionalmente celebran las fiestas de Nuestra Señora de la Candelaria, Patrona de la ciudad. Los esmaltes azules, plata y rojo, predominantes en el escudo recuerdan al fundador del pueblo, don Pedro Menéndez de Valdés, cuyo blasón familiar ostentaba como principales esos mismos esmaltes. La corona mural es insignia genérica de las municipalidades, como tal timbra los blasones de las ciudades, villas y pueblos.

Bandera Erronea

Esta bandera de Manatí con el escudo en el centro nunca ha existido. Según la Oficina de Asuntos Culturales de Manatí, ellos no saben de donde ha salido ya que su verdadera bandera y la que siempre han estado utilizando es la primera que aparece arriba, osea sin el escudo. La bandera comprende de tres franjas: Blanca, Roja y Azul. La franja roja es la mitad de ancho que las otras dos franjas.