La bandera de Morovis se divide verticalmente en dos partes iguales. La inmediata al asta es amarilla y Ileva el águila del escudo, en este caso con la cabeza hacia la diestra de la bandera. La otra mitad está dividida en siete franjas verticales de igual anchura, cuatro rojas alternadas con tres amarillas.
En campo de oro, un águila pasmada de sable, picada y membrada de gules, su cabeza nimbada y entornada, partido de gules con cinco cuatros (Guitarras puertorriqueñas) de oro, puestas en aspa; y en abismo, en escusón, el Blasón de la Orden del Carmen. Al timbre, corona mural de oro de tres torres, mamposteada de sable y adjurada de gules. El águila nimbada representa a San Juan, apóstol y evangelista, cuyo nombre lo tuvo el fundador del pueblo, don Juan Evangelista Rivera. Los cuatros simbolizan la importancia de Morovis como centro productor del típico instrumento musical puertorriqueño, que en el pueblo y su territorio ha tenido, además, numerosos intérpretes. El blasón de la Orden de Carmelo representa a Nuestra Señora del Carmen patrona de Morovis. La corona mural es insignia genérica de ciudades y municipios y simboliza las libertades municipales y la unión y la solidaridad de los hijos de un mismo pueblo.
