La bandera de Peñuelas fue diseñada mediante un proyecto del Instituto de Cultura Puertorriqueña. Tiene un fondo rectangular en color amarillo intenso que significa el sol símbolo de la vida física. En su centro tiene una cruz color púrpura o violeta: símbolo del cristianismo y su orden eclesiástica; representa la vida espiritual. La cruz púrpura se extiende a todos los puntos del rectángulo amarillo, como símbolo de la universalidad del cristianismo y de la iglesia. Este proyecto de la Bandera de peñuelas fue creado en el año 1974.

Fue creado en el 1974, por medio de proyecto del Instituto de Cultura Puertorriqueña, a cargo del Sr. Rodríguez y financiado con fondos federales. El adorno sobre el escudo, un muro de piedra, representa la perpetuidad. La cruz representa el Santo Cristo de la Salud que detuvo el mar que inundó a Peñuelas. El brazo color púrpura representa al sacerdocio y al pueblo de Peñuelas. El color amarillo representa el sol. El azul y el blanco simbolizan el mar agitado y la regia enseña repre- senta la fe en el cristianismo, "En Dios confiamos ".