Blasón de forma cuadrilonga, redondeada en su forma inferior y timbrado de corona mural de tres piezas (torres). Trae por soportes , dos Delfines y debajo de la base un volante con la inscripción Santiago de Fajardo. Colores: En campo azul con balandro de plata en dirección al franco diestro con gripola y velas desplegadas, navegando sobre mar ondeando de plata: dos gaviotas en vuelo también de ídem, una a cada lado de velamen. Bordura de gules (rojo ) cubierta de mulla de sable (negra) con ocho vaneras (conchas) de plata equidistantes unas a otras. Corona mural de tres torres, aclarada de azul y mazonada de sable. Trae por soporte un delfín pasmado y curbado a cada lado. Al pie de su base, un volante de plata con la inscripción de sable: Santiago de Fajardo.
Descripción de la bandera: De tipo rectangular, tricolor, compuesta de tres franjas. La primera (superior) de gules (rojo) simbolizando el color de la bordura de escudo. La segunda (de centro ) de blanco (plata) simbolizando el color de las piezas principales que aparecen en el blasón y su corona. La tercera (inferior) de azul simbolizando el color del cielo y el mar de Fajardo. Al centro el escudo oficial de la Villa en sus colores naturales.
HIMNO
Letra: Juan R Marrero 1997
Fajardo que aquí en el oriente,
paciente como un pescador,
atrapas en el horizonte
el primer rayito de sol
Lo reflejas en Sardinera
lo esparces a tu alrededor
llevándole la luz a Boriquén
que brilla como un prendedor.
Fajardo escogido del cielo
mi pequeño pueblo quiero
decirte que eres orgullo
de todo buen Fajardeño
Así vivas sierra adentro
o en la playa Puerto Real
Fajardo que aquí en el oriente,
paciente como un pescador
atrapas en el horizonte,
el primer rayito de sol.
Lo refeljas en Sardinera
lo esparces a tu alrededor
llevándole luz a Borinquen
que brilla como un prendedor.
